1、已被修订，根据《国务院关于取消和调整一批行政审批项目等事项的决定》（国发〔2014〕50号），取消本办法“汇总纳税企业组织结构变更审核”

2、条款废止，根据《国家税务总局关于3项企业所得税事项取消审批后加强后续管理的公告》（国家税务总局公告2015年第6号），自2015年1月1日起废止本文第二十四条第三款“汇总纳税企业以后年度改变组织结构的，该分支机构应按本办法第二十三条规定报送相关证据，分支机构所在地主管税务机关重新进行审核鉴定”的规定

3、已被修订，根据《国务院关于第一批取消62项中央指定地方实施行政审批事项的决定》（国发〔2015〕57号），取消地方税务机关对汇总纳税企业组织结构变更审核

4、已被修订，根据《国家税务总局关于发布《中华人民共和国企业所得税月（季）度预缴纳税申报表（a类，2018年版）》等报表的公告》（国家税务总局公告2018年第26号），执行本公告《跨地区经营汇总纳税企业所得税征收管理办法》的跨地区经营汇总纳税企业的分支机构，自2018年7月1日起使用《中华人民共和国企业所得税月（季）度预缴纳税申报表（a类，2018年版）》进行月度、季度预缴申报和年度汇算清缴申报

5、条款修订，根据《国家税务总局关于修改部分税收规范性文件的公告》（国家税务总局公告2018年第31号），对本文第三十二条进行了修改

6、条款废止，根据《国家税务总局关于企业所得税年度汇算清缴有关事项的公告》（国家税务总局公告2021年第34号），本文第十条“或者经总、分机构同意后分别抵缴其下一年度应缴企业所得税税款”的规定自2021年1月1日起废止，适用于2021年度及以后年度企业所得税汇算清缴